连建伟认为，胆为“中正之官”，清净之腑，恶烦扰，恶壅郁；又主决断，谋虑出焉，若病后，或久病而宿有痰饮未消，胸膈余热未尽；或胃中痰饮邪热郁结，胃失和降，痰热必然随胃气之逆而犯胆腑，使其欲清不得，欲静不能，必伤少阳温和之气，以致虚烦不得眠、胆怯心悸等。方中半夏辛温，燥湿祛痰、和胃降逆，为君药。陈皮辛苦温，燥湿化痰、和胃，茯苓健脾祛湿，生姜辛温，祛痰止呕，又可解半夏之毒，均为臣药。竹茹性寒，清热涤痰、除烦止呕；枳实苦微寒，下气行痰，与半夏相配，气顺痰消，气滞得畅，胆胃得和，均为佐药。少量甘草调和诸药，以为使。恐大枣之滋腻碍湿，故去之不用。诸药合用，化痰而不燥，清热而不寒，使痰热尽去，胆腑自然恢复其少阳温和之气，故以“温胆”名之。
祛湿为要，调气温运，分消走泄
《素问·异法方宜论》记载了“一病而治各不同”，乃“地势使然也”。连老十分重视自然环境对疾病的发生以及转化的影响，认为江浙为水乡之地，湿盛之地，人在其间，无以避之，脾极易为湿邪所伤。《临证指南医案·湿》云：“湿为重浊之邪，若邪从外而受者，皆由地中之气升腾，从内而生者，皆由脾阳之不运。虽云雾露雨湿，上先受之，地中潮湿，下先受之。”脾之健运升清，依赖脾阳的温煦。若脾阳不足，则寒湿内生，壅滞中焦，使气血化生无源。须湿邪得化，脾方能健运。
连老认为，脾喜燥恶湿，易为湿困，故脾病须细察有无兼湿，然后权衡虚实，孰为主次而兼治之。如湿邪重浊困脾者，首要调畅气机，正如《温病条辨》所云：“气化则湿亦化。”如三仁汤、平胃散、胃苓汤、藿香正气散等随证加减，意在通过芳化、苦燥、淡渗等法祛湿醒脾，复其灵动之性。至于脾气虚弱而生湿者，老师善用温阳法。脾气虚者，临床用四君子汤加减；兼气滞，则加陈皮补气行滞化湿；若兼痰浊，则加制半夏以燥湿化痰。脾气湿者，选用参苓白术散、资生丸健脾、渗湿止泻。如脾阳不足，寒湿内生，症见脘腹冷痛、下利清谷、肢体肿胀等，则善用理中丸或附子理中汤以治之。
临证常有湿蕴化热，湿与热胶结为患，郁闭气枧。如见口干咽苦，便结溲黄，苔黄厚燥，此为热重于湿，连老常于化湿之方中佐以黄连、黄芩、蒲公英、白花蛇舌草等清热之品，尤须注意苦寒清热量不宜大以防损伤脾阳，败坏胃气，贻误病机。
统筹攻补，补而勿滞，泻而勿损
经云：“阳道实，阴道虚。”脾为至阴之脏，其病多虚；胃为阳热之腑，其病多实。脾虚证治以健脾补气、温中散寒之法，常用四君、理中之辈。胃实证治以泻热、通下、降气、消导之法，常用白虎、承气之类。连老强调，脾胃病往往虚实夹杂较多，临证不可一概而论。脾虚或兼有湿浊、湿热之实，胃实或亦有气阴之虚。因此，久病或老年体虚病者，每见寒热虚实夹杂，治当寒温并调，虚实同顾，攻补兼施。
脾胃虚证，常以甘药补之，然须把握气机之升降，分清气虚气滞之不同。甘味之品易滞气生满、助湿生痰，常配伍陈皮、佛手、木香、苏梗等导滞又甘能生湿，妨碍运化，凡因湿浊、饮邪阻滞中焦引起的呕吐痞满证，当忌用甘药。胃阴虚正忌滋腻壅塞之剂，宜清补、平补，以达胃健纳旺之目的，常用沙参、麦冬、石斛、玉竹、扁豆之类，补而不腻。如用熟地等滋腻补药时，常酌加陈皮、砂仁、木香等健脾之品，以防粘膩呆滞脾胃。
若胃火蕴结、阳明腑实、脾蕴湿热等实热证候，运用黄连、大黄、龙胆草之类苦寒之药，须详加辨证，否则偾事。若为胃气虚弱，寒凝中焦，误投苦寒方药，则伤阳败胃，或化燥竭阴。此外，胃喜润恶燥，对于木香、砂仁、苍术、厚朴、陈皮等辛香温散之辈，虽有散结消痞之功，用于脾胃气滞、湿阻、食积等证，但若久用重用，也必耗伤胃气。干姜、附子、肉桂等辛热温燥之品，虽有温中散寒之力，然亦不可用之太过，谨防胃之阴津受耗。攻伐之剂，多为峻烈之品，祛邪之力猛，然伤胃之虑亦深，故常佐以草、枣和缓之药，顾护胃气，中病即止，使病退而胃不伤。
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科研成果
发表专业论文80余篇，研究的科研项目有：“小半夏汤防治化疗呕吐作用实验研究”、“中医肾脏理论发生学研究”、“疏肝利湿法对利福平所致肝损伤的保护作用”、“抗结核药诱导肝损伤大鼠模型的研制”等，其中：《金匱要略校注》获国家中医药管理局1992年度中医药科技进步二等奖，“中医肾脏理论发生学研究”获2001年省中医药管理局科技进步二等奖，“课程建设标准及评估指标体系的研究与实践”获得2003年省教育科委“九五”规划重大研究成果二等奖，《三订通俗伤寒论》获得2004年中华中医药学会科技奖学术著作奖，“小半夏防治化疗呕吐作用实验研究”获浙江省教育厅科技进步三等奖。