财务软件需要到财政局备案方可使用，有的代理记账单位没有采用财政部批准的财务软件来替代手工记账。
会计资料交接麻烦、不够规范。代理记账单位在接受委托单位的会计原始凭证及资料时，没有办理交接手续，发现遗失或毁损时无法查找。
代理记账单位通常是定期或定时上门服务，日常业务可通过电话沟通，会计不是随时在单位办理和咨询业务。
代理记账机构必须有3名以上持有会计从业资格证书的专职从业人员，且主管代理记账业务的负责人必须具有会计师以上专业技术职称资格。但实际执行中，相当部分的代理记账机构不符合此规定。
代理记账业务工作程序：
a. 签订《代理记账业务约定书》，约定双方的权利和义务;
b.根据公司情况，设立公司账簿，进行建账初始化;
c.指导出纳完成现金日记账、银行存款日记账;存货仓库明细账;
d.审核凭证，登记账簿，编制报表，填写纳税申报表;
新疆慧中财务管理咨询有限公司是一家专业从事工商注册代办、财务代理、税务代理、资质代办的综合性代办公司。公司成立14年，信誉卓著，不仅拥有涉税经验丰富、业务素质高的会计队伍、缜密规范的工作程序、积极热情的服务态度；同时拥有丰富的经验和良好的渠道，更能协调好企业与工商、税务等部门的关系，为中小企业与相关行政执法之间架起沟通的桥梁，帮助中小企业在财税上做到省时、省钱、省心，放心办公司，真正做到创业无忧。
