分阶段认证审核阶段
阶段审核：审核组先开展文件评审，核查体系文件是否贴合 GJB9001C 标准，尤其关注军工条款的落地情况；再进行初步现场走访，了解企业基本运营状况，确认是否具备开展第二阶段审核的条件，同时可能与军方用户座谈了解产品相关情况。
第二阶段审核：通常在阶段问题整改完成后 4 个月内开展，属于的现场审核。审核组会深入生产车间、保密室等场所，核查涉密管理、关键工序控制、产品追溯性等情况，抽查各类记录凭证，并验证双归零报告等文件的真实性，确认体系运行的有效性。若审核发现问题，会开具一般或严重不符合项通知。
整改与发证阶段
限期整改问题：企业需在 30 天内针对不符合项分析根源，制定纠正措施并落实，同时提交整改证据，比如修订后的文件、第三方检测报告等，确保问题整改到位且形成闭环管理。
审批并颁发证书：审核组验证整改有效后，认证机构完成内部报批流程，向企业颁发认证证书。证书有效期为 3 年，且会录入国家认证注册名录，可在国家认监委官网查询。
质量管理体系相关文件
核心体系文件：包含质量手册（明确质量方针、组织架构、职责权限等）、程序文件（至少涵盖设计开发、采购控制等 25 项标准要求的程序文件），以及作业指导书、工艺规程等实操性文件。
体系运行记录：内部审核报告及对应的整改闭环记录；管理评审报告及后续改进措施文件；质量目标达成情况统计表，以此证明体系试运行满 3 个月且运行有效。
业务与生产支撑材料
业务关联证明：军品订单、科研生产任务书，民营企业通常还需提供装备主管部门或军事代表机构出具的推荐意见书；《产品所在阶段情况调查表》，若涉及多个军方用户需分别提供。
生产流程与设备资料：产品实现流程图，清晰展示生产全流程及关键控制点；主要设备一览表，同时附上设备台账、维护保养记录，以及计量器具的检定或校准证书。
全流程业务记录：采购环节的合格供方名录、评价记录及采购合同；生产环节的关键过程参数监控记录、首件检验和最终检验记录；设计开发环节的产品需求规格书、设计验证报告、技术状态变更记录等。